Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Efr3aQ8BG67 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efr3aQ8BG67 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms