Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Katnb1Q8BG40 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Katnb1Q8BG40 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms