Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG27

9930022D16Rik, RIKEN cDNA 9930022D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930022D16RikQ8BG27 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
9930022D16RikQ8BG27 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9930022D16RikQ8BG27 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms