Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M10.4Q85ZW8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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