Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nmes1Q810Q5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nmes1Q810Q5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms