Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx32Q80ZJ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx32Q80ZJ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms