Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otop3Q80UF9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otop3Q80UF9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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