Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms