Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Avl9Q80U56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms