Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp3Q7TST5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms