Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms