Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdp1Q7TSG2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms