Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actn1Q7TPR4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms