Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM8

Parp16, Mono [ADP-ribose] polymerase PARP16, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp16Q7TMM8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp16Q7TMM8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp16Q7TMM8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms