Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf2Q7TMI3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms