Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpalinQ7M750 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OpalinQ7M750 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms