Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd2Q7JJ13 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms