Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GypcQ78HU7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GypcQ78HU7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms