Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1cQ76I25 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1cQ76I25 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms