Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35Q6ZWV7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms