Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Topbp1Q6ZQF0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms