Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Igsf3Q6ZQA6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igsf3Q6ZQA6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms