Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm3bQ6ZPY7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms