Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc44a1Q6X893 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms