Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc88cQ6VGS5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms