Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil2Q6R2P8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms