Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nudcd1Q6PIP5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nudcd1Q6PIP5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms