Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sort1Q6PHU5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms