Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmeff1Q6PFE7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms