Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrm2bQ6PEE3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrm2bQ6PEE3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms