Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd4Q6PDQ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd4Q6PDQ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms