Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb39Q6PDK0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms