Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms