Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdac10Q6P3E7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac10Q6P3E7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac10Q6P3E7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms