Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Stmnd1Q6P3A1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stmnd1Q6P3A1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms