Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc189Q6NZQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc189Q6NZQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms