Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Asic1Q6NXK8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Asic1Q6NXK8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Asic1Q6NXK8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asic1Q6NXK8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asic1Q6NXK8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms