Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc3bQ6NWW9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc3bQ6NWW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc3bQ6NWW9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms