Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HelbQ6NVF4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HelbQ6NVF4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms