Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q6GQU0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6GQU0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms