Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smarca2Q6DIC0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca2Q6DIC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms