Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PnkdQ69ZP3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PnkdQ69ZP3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms