Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msl2Q69ZF8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms