Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrcc1Q69ZB0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrcc1Q69ZB0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms