Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp4Q68FH0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms