Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn2Q68FG2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn2Q68FG2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn2Q68FG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms