Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Git1Q68FF6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Git1Q68FF6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Git1Q68FF6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Git1Q68FF6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Git1Q68FF6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Git1Q68FF6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Git1Q68FF6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Git1Q68FF6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Git1Q68FF6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms