Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab3ipQ68EF0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab3ipQ68EF0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms