Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp9bQ66X22 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9bQ66X22 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp9bQ66X22 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms