Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja3Q64448 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja3Q64448 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja3Q64448 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms